Zakład ​Struktury i Funkcji Retrotranspozonów

prof. dr hab. Wojciech Rypniewski

dr hab. Katarzyna Pachulska-Wieczorek

Kierownik Zakładu


kasiapw@ibch.poznan.pl
tel. wew. 1193, 1236

Pracownicy naukowi

dr Katarzyna Purzycka
adiunkt

Działalność badawcza

Tematyka badawcza
  • Korelacja pomiędzy strukturą RNA a jego funkcją i stabilnością w komórce
  • Zmiany struktury RNA w trakcie jego życia w komórce
  • Struktura RNA wirusów i retrotransposzonów na różnych etapach replikacji oraz w kompartmentach komórki
  • Mechanizm pakowania genomowego RNA do cząstek wirusopodobnych (VLPs) oraz wirionów
  • Białka Gag i Gag pochodne, odziaływanie z RNA oraz funkcje
  • Narzędzia komputerowe do wizualizacji i analizy statystycznej danych z eksperymentów mapowania struktury 2D RNA (RNAthor)
  • Modelowanie struktury drugorzędowej RNA z wykorzystaniem danych eksperymentalnych (np. SHAPE, DMS)
  • Analiza porównawcza modeli strukturalnych RNA
  • Mechanizmy kontroli mobilności retrotranspozonów (współpraca D.J. Garfinkel, UGA USA)
Słowa kluczowe
  • Struktura RNA w komórce
  • Mapowanie struktury RNA
  • Oddziaływania RNA-białko
  • Bioinformatyka strukturalna
  • LTR-retrotranspozony (Ty1, Ty3),
  • Retrowirusy,
  • Drożdże,
  • Gag
  • Arc

Projekty badawcze

  • Struktura RNA i jego oddziaływania z białkiem Gag warunkujące funkcje RNA Ty1 na różnych etapach replikacji retrotranspozonu, NCN – SONATA BIS 6
  • Arc jako neuronalny Gag. Badanie wirusowych właściwości i funkcji głównego regulatora plastyczności synaptycznej., NCN- PRELUDIUM 18
  • Effectory mobilności retrotranspozonów. Zadanie: Wpływ faktorów restrykcyjnych na strukturę i dynamikę RNA Retrotranspozonów. PI D.J. Garfinkel, UGA USA, NIH
Skip to content