Z-d Biochemii Rybonukleoprotein

Zakład Biochemii Rybonukleoprotein

dr hab. Anna Kurzyńska-Kokorniak, prof. ICHB PAN
Kierownik Zakładu

akurzyns@ibch.poznan.pl
tel. 1264

Pracownicy naukowi

dr Kamil Szpotkowski
adiunkt

Doktoranci

mgr Kinga Ciechanowska
doktorant/biolog

mgr inż. Marta Wojnicka
doktorant

mgr inż. Agnieszka Szczepańska
doktorant/biolog

Działalność badawcza

Tematyka badawcza

rola RNA/ DNA w regulacji aktywności i funkcji białek wiążących kwasy nukleinowe,
mechanizmy regulacji ekspresji genów,
warianty Dicer (gen, transkrypt, białko),
endogenne regulatory aktywności rybonukleaz typu Dicer,
projektowanie i testowanie inhibitorów rybonukleaz typu Dicer w wybranych modelach badawczych,
badanie aktywności rybonukleaz typu Dicer w kontekście infekcji wirusowych, wirusowe miRNA
poszukiwanie nowych obszarów aktywności rybonukleaz typu Dicer: aktywność opiekuńcza (chaperonowa) Dicer wobec kwasów nukleinowych,
choroby związane z nieprawidłowym działaniem Dicer.

Słowa kluczowe

białka wiążące kwasy nukleinowe,
rybonukleazy typu Dicer,
regulatorowe RNA,
oddziaływania RNA-białko, oddziaływania DNA-białko,
regulacja aktywności rybonukleaz typu Dicer,
regulacja ekspresji genów.

Projekty badawcze

Niepoznane obszary aktywności ludzkiej rybonukleazy Dicer. NCN – SONATA BIS 6

Wybrane publikacje

Koralewska N, Szczepanska A, Ciechanowska K, Wojnicka M, Pokornowska M, Milewski MC, Gudanis D, Baranowski D, Nithin C, Bujnicki JM, Gdaniec Z, Figlerowicz M, Kurzynska-Kokorniak A*. RNA and DNA G-quadruplexes bind to human dicer and inhibit its activity. Cell Mol Life Sci. 2021; doi: 10.1007/s00018-021-03795-w.
Ciechanowska K, Pokornowska M, Kurzyńska-Kokorniak A*. Genetic Insight into the Domain Structure and Functions of Dicer-Type Ribonucleases. Int J Mol Sci. 2021; 22(2):616. doi: 10.3390/ijms22020616.
Pokornowska M, Milewski MC, Ciechanowska K, Szczepańska A, Wojnicka M, Radogostowicz Z, Figlerowicz M, Kurzynska-Kokorniak A*. The RNA-RNA base pairing potential of human Dicer and Ago2 proteins. Cell Mol Life Sci. 2020; 77(16):3231-3244. doi: 10.1007/s00018-019-03344-6.
Wojnicka M, Szczepanska A, Kurzynska-Kokorniak A*. Unknown Areas of Activity of
Human Ribonuclease Dicer: A Putative Deoxyribonuclease Activity. Molecules. 2020; 25(6):1414. doi: 10.3390/molecules25061414.
Koralewska N, Ciechanowska K, Pokornowska M, Figlerowicz M, Kurzyńska-Kokorniak A*. Human ribonuclease Dicer – structure and functions. Postepy Biochem. 2019; 65(3):173-182. doi: 10.18388/pb.2019_267.
Milewski MC, Kamel K, Kurzynska-Kokorniak A, Chmielewski MK, Figlerowicz M. EvOligo – a novel software to design and group libraries of oligonucleotides applicable for nucleic acid-based experiments. J Comput Biol. 2017; 24(10):1014-1028. doi: 10.1089/cmb.2016.0154.
Mickiewicz A, Sarzyńska J, Miłostan M, Kurzynska-Kokorniak A, Rybarczyk A, Łukasiak P, Kuliński T, Figlerowicz M, Błażewicz J. Modeling of the catalytic core of Arabidopsis thaliana Dicer-like 4 protein and its complex with double-stranded RNA. Comput Biol Chem. 2017; 66:44-56. doi: 10.1016/j.compbiolchem.2016.11.003.
Kurzynska-Kokorniak A*, Pokornowska M, Koralewska N, Hoffmann W, Bienkowska-Szewczyk K, Figlerowicz M. Revealing a new activity of the human Dicer DUF283 domain in vitro. Sci Rep. 2016; 6:23989. doi: 10.1038/srep23989.
Koralewska N, Hoffmann W, Pokornowska M, Milewski M, Lipinska A, Bienkowska-Szewczyk K, Figlerowicz M, Kurzynska-Kokorniak A*. How short RNAs impact the human ribonuclease Dicer activity: putative regulatory feedback-loops and other RNA-mediated mechanisms controlling microRNA processing. Acta Biochim Pol. 2016; 63(4):773-783. doi: 10.18388/abp.2016_1339.
Tworak A, Urbanowicz A, Podkowinski J, Kurzynska-Kokorniak A, Koralewska N, Figlerowicz M. Six Medicago truncatula Dicer-like protein genes are expressed in plant cells and upregulated in nodules. Plant Cell Rep. 2016; 35(5):1043-52. doi: 10.1007/s00299-016-1936-8.
Kurzynska-Kokorniak A, Koralewska N, Pokornowska M, Urbanowicz A, Tworak A, Mickiewicz A, Figlerowicz M. The many faces of Dicer: the complexity of the mechanisms regulating Dicer gene expression and enzyme activities. Nucleic Acids Res. 2015; 43(9):4365-80. doi: 10.1093/nar/gkv328.

IBCH logo

Zakład Biochemii Rybonukleoprotein

Pracownicy naukowi

Doktoranci

Działalność badawcza

Tematyka badawcza

Słowa kluczowe

Projekty badawcze

Wybrane publikacje

Adres

Zakład Biochemii Rybonukleoprotein

Pracownicy naukowi

Doktoranci

Działalność badawcza

Tematyka badawcza

Słowa kluczowe

Sample Title

Projekty badawcze

Wybrane publikacje